Der Missionsrat ist verantwortlich für die Initiierung und Begleitung der verschiedenen Gründungsprojekte. Er stellt die verschiedene Ressourcen und Angebote für die Gemeindegründer zur Verfügung. Er informiert regelmässig über das Ergehen der bestehenden Gründungsprojekte und mobilisiert eine stetig wachsende Basis von Gemeinden und Christen für den Bereich Gemeindegründung. Er wird geleitet von Hans-Jörg Rätz.